Immune cell enrichment characteristics and related key genes in intrauterine adhesion: insights from RNA-sequencing analysis.

چکیده اصلی

Intrauterine adhesion (IUA) represents a prevalent cause of persistent infertility and continues to be a significant unresolved challenge in reproductive medicine. However, its full pathogenic mechanisms remain incompletely elucidated. We retrieved endometrial RNA-sequencing data from IUA patients and normal controls in the Gene Expression Omnibus (GEO) database, and screened 586 differentially expressed genes (DEGs) in the endometrium of IUA patients using the R package limma. Gene Ontology (GO), Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG), and gene set enrichment analysis (GSEA) revealed activation of immune-related pathways, including chronic inflammatory response, complement activation, and complement and coagulation cascades in IUA. Further single-sample gene set enrichment analysis (ssGSEA)-based relative immune cell enrichment analysis revealed decreased enrichment scores of activated CD4 T cells and type 2 T helper cells, alongside increased enrichment scores of effector memory CD8 T cells, macrophages, mast cells, natural killer cells, and T follicular helper cells in IUA patients, indicating their potential involvement in IUA pathogenesis. A protein-protein interaction (PPI) network was constructed, identifying 10 hub genes associated with IUA: CDK1, CCNB1, CCNA2, CENPA, BUB1, AURKB, KIF11, BUB1B, CDC20, and TOP2A. The expression patterns of these genes were further validated in two independent external IUA cohorts, supporting a potential correlative link between these genes and IUA pathogenesis. Our findings provide exploratory insights and potential candidate molecules for subsequent mechanistic studies of IUA onset and progression.

ترجمه فارسی چکیده

آدنوزین داخل رحمی (IUA) یک علت شایع ناباروری مزمن است و همچنان چالش مهمی در پزشکی باروری است. مکانیسم‌های کامل بیماری‌زایی هنوز به‌طور کامل روشن نشده‌اند. داده‌های توالی‌ریبونوکلئیک اندومتر از بیماران IUA و کنترل‌های طبیعی در پایگاه داده Gene Expression Omnibus (GEO) بازیابی شد و ۵۸۶ ژن متفاوت بیان شده (DEG) در اندومتر بیماران IUA با استفاده از بسته R limma غربالگری شد. تحلیل‌های GO، KEGG و GSEA نشان‌دهنده فعال‌سازی مسیرهای مرتبط با ایمنی، از جمله پاسخ التهابی مزمن، فعال‌سازی کمپلمنت و زنجیره‌های کمپلمنت و انعقاد در IUA بودند. تحلیل غنی‌سازی سلول ایمنی مبتنی بر ssGSEA نشان داد امتیازات غنی‌سازی کاهش یافته برای سلول‌های T CD4 فعال و سلول‌های کمکی T نوع ۲، همراه با افزایش امتیازات غنی‌سازی برای سلول‌های T CD8 حافظه اثرگرا، ماکروفاژها، مازوسیت‌ها، لنفوسیت‌های طبیعی و سلول‌های کمکی فولیکولی T در بیماران IUA، که نشان‌دهنده درگیری بالقوه آن‌ها در بیماری‌زایی IUA است. یک شبکه تعامل پروتئین-پروتئین (PPI) ساخته شد که ۱۰ ژن هاب مرتبط با IUA را شناسایی کرد: CDK1، CCNB1، CCNA2، CENPA، BUB1، AURKB، KIF11، BUB1B، CDC20 و TOP2A. الگوهای بیان این ژن‌ها در دو کوهورت خارجی مستقل IUA تأیید شد و ارتباط بالقوه بین این ژن‌ها و بیماری‌زایی IUA پشتیبانی شد. یافته‌های ما بینش‌های اکتشافی و مولکول‌های بالقوه را برای مطالعات مکانیسمی آغاز و پیشرفت IUA ارائه می‌دهند.

متن کامل اصلی