PubMed چکیده/رکورد

An Integrated Workflow for Culturing and AI-Based Profiling of Mouse Intestinal Epithelium.

استودیوی صوتی مقاله

پخش حرفه‌ای فارسی و انگلیسی

در حال بررسی نسخه‌های صوتی ذخیره‌شده…

صوت تولیدشده با هوش مصنوعی است. برای کاربرد علمی یا درمانی، متن و منبع اصلی را بررسی کنید.
خواندن هوشمند فارسی و انگلیسی در حال آماده‌سازی صداهای مرورگر…
تنظیم صدای طبیعی و سرعت

صداهایی که در نامشان «Natural»، «Neural» یا «Online» دیده می‌شود معمولاً طبیعی‌ترند. انتخاب صدا به صداهای نصب‌شده در ویندوز و مرورگر شما بستگی دارد.

چکیده اصلی

Two-dimensional (2D) culture systems are powerful in vitro tools that have revolutionized the study of intestinal stem cell biology. These culture systems derived from mouse intestinal and colonic epithelia enable the modeling of tissue architecture, barrier function, and disease mechanisms under physiologically relevant conditions. This protocol details methods for isolating and maintaining mouse intestinal crypts as 2D monolayers. Monolayers are established via enzymatic dissociation and seeding onto ECM-functionalized hydrogels. This protocol also describes a deep learning pipeline that performs virtual fluorescent staining of label-free phase-contrast images of live organoids. This protocol enables the reproducible generation and computational analysis of murine intestinal epithelial cultures for studies in epithelial biology, drug testing, and disease modeling. This integrated system is designed for facilitating high-throughput imaging, immunolabeling, and functional analysis, expanding its use in regenerative medicine, tissue engineering, and gastrointestinal research.

نتیجه فارسی

این پروتکل روش‌های کشت اپیتلیوم روده موش به صورت لایه‌های تک‌لایه را توصیف می‌کند و از آن برای رنگ‌آمیزی فلوئورسنت مجازی با استفاده از یادگیری عمیق در تصاویر فاز-کنتراست استفاده می‌کند. این سیستم یکپارچه برای مطالعات زیست‌شناسی اپیتلیوم، تست دارو و مدل‌سازی بیماری طراحی شده است.

  • کشت لایه‌های تک‌لایه از کریپت‌های روده موش با استفاده از تجزیه آنزیمی و هیدروژل‌های کارکرده با ماتریس خارج سلولی انجام می‌شود.
  • یک خط لوله یادگیری عمیق برای رنگ‌آمیزی فلوئورسنت مجازی از تصاویر فاز-کنتراست بدون برچسب ارگانوئیدهای زنده پیاده‌سازی شده است.
  • این سیستم برای مطالعات زیست‌شناسی اپیتلیوم، تست دارو و مدل‌سازی بیماری و همچنین پزشکی بازسازی‌پذیر و مهندسی بافت کاربرد دارد.

ترجمه فارسی چکیده

سیستم‌های کشت دو بعدی (2D) ابزارهای قدرتمند in vitro هستند که مطالعات زیست‌شناسی سلول‌های بنیادی روده را متحول کرده‌اند. این سیستم‌های کشت حاصل از اپیتلیوم روده و کولون موش، مدل‌سازی بافت، عملکرد سد و مکانیسم‌های بیماری را تحت شرایط مرتبط با فیزیولوژی ممکن می‌سازند. این پروتکل روش‌های جداسازی و نگهداری لایه‌های تک‌لایه (monolayers) از کریپت‌های روده موش را شرح می‌دهد. لایه‌های تک‌لایه از طریق تجزیه آنزیمی و کشت روی هیدروژل‌های کارکرده با ماتریس خارج سلولی (ECM) ایجاد می‌شوند. این پروتکل همچنین یک خط لوله یادگیری عمیق را توصیف می‌کند که رنگ‌آمیزی فلوئورسنت مجازی از تصاویر فاز-کنتراست بدون برچسب (label-free) از ارگانوئیدهای زنده را انجام می‌دهد. این سیستم یکپارچه برای تولید قابل تکرار و تحلیل محاسباتی کشت‌های اپیتلیوم روده موش برای مطالعات در زیست‌شناسی اپیتلیوم، تست دارو و مدل‌سازی بیماری طراحی شده است. این سیستم برای تسهیل تصویربرداری با ظرفیت بالا، رنگ‌آمیزی ایمونولوژیک و تحلیل عملکردی، استفاده آن را در پزشکی بازسازی‌پذیر، مهندسی بافت و تحقیقات گوارشی گسترش می‌دهد.

روش پژوهش

کریپت‌های روده موش از طریق تجزیه آنزیمی جدا شده و روی هیدروژل‌های کارکرده با ماتریس خارج سلولی کشت می‌شوند. یک خط لوده یادگیری عمیق برای تحلیل تصاویر فاز-کنتراست بدون برچسب استفاده می‌شود.

محدودیت‌ها

محدودیت‌ها در متن گزارش نشده‌اند.

استخراج ساختاریافته از متن منبع

نمای PICO و پیامدها

جمعیت
اپیتلیوم روده و کولون موش
مداخله/مواجهه
کشت لایه‌های تک‌لایه (monolayers) از کریپت‌های روده موش و خط لوده یادگیری عمیق برای رنگ‌آمیزی فلوئورسنت مجازی
مقایسه
در متن گزارش نشده است.
حجم نمونه
در متن گزارش نشده است.

متن کامل اصلی

متن در JumpToDate ذخیره نشده است.

برای بررسی دسترسی کتابخانه‌ای یا خرید، رکورد اصلی را باز کنید.

رفتن به منبع اصلی

کلیدواژه‌ها

AIBioinformaticsImagingIntestineMonolayersPipeline
در همین زیرشاخه

مقاله‌های مرتبط

PubMed2027

A Defined Strategy for Multi-Lineage Differentiation of Gastric Organoids.

In the gastric glands, adult stem cells differentiate into multiple epithelial lineages, including pit mucous cells, acid-secreting parietal cells, and enzyme-producing chief cells. Efficient and controllable lineage specification from adult gastric stem cells is essential for modeling gastric homeostasis and disease in vitro. Organoids are a good model for investigating cell differentiation and organ formation. However, methods to ach…

PubMed2027

A Standardized Protocol for Generating iPSC-Derived Human Microglia for Functional Genomic Assays.

Human induced pluripotent stem cell (iPSC)-derived microglia (iMG) provide an in vitro experimental system for studying human microglial biology, neuroinflammation, and genetic risk mechanisms associated with neurological disease. This chapter describes a standardized, scalable, and reproducible protocol for the differentiation of human iPSCs into functional microglia-like cells, with particular emphasis on applications in transcriptio…

PubMed2027

Alkaline Phosphatase Staining of Embryonic Stem Cells.

Alkaline phosphatase (AP) is a widely utilized histochemical marker for assessing the pluripotent state of embryonic stem (ES) cells. Mouse ES cells maintained in an undifferentiated state exhibit high levels of tissue-nonspecific alkaline phosphatase (TNAP) activity, which sharply declines upon differentiation. AP staining provides a rapid, cost-effective, and reliable method to evaluate ES cell colony morphology, confirm maintenance …

PubMed2027

An Electroporation-Based Protocol for Ex Vivo Base Editing: From Design to Quantitative Assessment.

Base editing is a CRISPR variant approach that enables single-nucleotide conversions without generating double-strand breaks. Cytosine and adenine base editors mediate C•G to T•A and A•T to G•C transitions, respectively, by coupling a deaminase to a catalytically impaired Cas9, a modified nuclease that lacks DNA cleavage activity but retains DNA binding capability. By avoiding double-strand breaks, base editing limits reliance on unpre…