RT-RPA-Assisted CRISPR/Cas12a-Based Isothermal Detection of Chikungunya Virus.

چکیده اصلی

Chikungunya virus (CHIKV) is transmitted through the bite of Aedes mosquitoes, specifically A. aegypti and A. albopictus. CHIKV belongs to the alphavirus with a positive-sense ssRNA genome of 11-12 kb size. The virus has been reported from various geographical regions across the globe. Chikungunya fever is an acute febrile illness, which, if left untreated, may develop into chronic arthralgia that may persist for several months or acute encephalitis syndrome. Therefore, early diagnosis of CHIKV is crucial to initiate prompt supportive treatment. Laboratory diagnosis of CHIKV typically relies on serological tests such as IgM antigen capture ELISA and molecular methods including RT-PCR or qRT-PCR. However, both these methods are not viable in peripheral settings. This chapter highlights recent advancements in molecular detection techniques for CHIKV, specifically isothermal detection methods that eliminate the requirement for complex instruments. The detection is facilitated by RT-RPA and CRISPR/Cas12a endonuclease. The assay offers advantages over existing methods such as rapid and early detection, and eliminates cross-over contamination, ultra-sensitivity, high specificity, and ease of result interpretation.

ترجمه فارسی چکیده

ویروس چیکونگونیا (CHIKV) از طریق گزش مگس‌های آئدس، به‌ویژه آئدس آئیگوپتی و آئدس آلبوپیکتوس، منتقل می‌شود. این ویروس متعلق به آلفاویروس با ژنوم آران‌ای مثبت‌جهته به اندازه ۱۱ تا ۱۲ کیلوبایت است. این بیماری تب حاد است که اگر درمان نشود، می‌تواند به درد مفاصل مزمن که برای چندین ماه ادامه دارد یا سندرم انسفالیت حاد تبدیل شود. بنابراین، تشخیص زودهنگام CHIKV برای شروع درمان حمایتی فوری ضروری است. تشخیص آزمایشگاهی معمولاً بر اساس تست‌های سرولوژیک مانند ELISA مهار آنتی‌ژن IgM و روش‌های مولکولی مانند RT-PCR یا qRT-PCR است. با این حال، هر دو روش در محیط‌های محلی (پریمی) کاربردی نیستند. این فصل پیشرفت‌های اخیر در روش‌های تشخیص مولکولی را برای CHIKV، به‌ویژه روش‌های تشخیص ایزوترمال که نیاز به دستگاه‌های پیچیده را حذف می‌کنند، برجسته می‌کند. تشخیص با کمک آنزیم انتهونوکلیاز RT-RPA و CRISPR/Cas12a انجام می‌شود. این تست مزایایی نسبت به روش‌های موجود مانند تشخیص سریع و زودهنگام، حذف آلودگی متقاطع، حساسیت فوق‌العاده بالا، تخصص بالا و سادگی تفسیر نتایج ارائه می‌دهد.

متن کامل اصلی