PubMed چکیده/رکورد

Preparation of Postmortem Human Formalin-Fixed Paraffin-Embedded Frontal Cortex Tissue for Profiling Pyramidal Neurons Via Digital Spatial Profiling.

استودیوی صوتی مقاله

پخش حرفه‌ای فارسی و انگلیسی

در حال بررسی نسخه‌های صوتی ذخیره‌شده…

صوت تولیدشده با هوش مصنوعی است. برای کاربرد علمی یا درمانی، متن و منبع اصلی را بررسی کنید.
خواندن هوشمند فارسی و انگلیسی در حال آماده‌سازی صداهای مرورگر…
تنظیم صدای طبیعی و سرعت

صداهایی که در نامشان «Natural»، «Neural» یا «Online» دیده می‌شود معمولاً طبیعی‌ترند. انتخاب صدا به صداهای نصب‌شده در ویندوز و مرورگر شما بستگی دارد.

چکیده اصلی

Digital spatial profiling (DSP) facilitates RNA sequencing (RNA-seq) of small populations of cells, specifically ~20 pyramidal neurons in postmortem formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) human brain tissue. This approach enables precise expression profiling via RNA-seq data linked to spatially characterized samples utilizing tissue-bound probes. We present a comprehensive protocol for manual slide preparation using the GeoMx DSP system as preliminary steps to spatial characterization of lamina-specific pyramidal neurons in human postmortem Brodmann area 9 (BA9) frontal cortex brain tissue.

نتیجه فارسی

این مقاله یک پروتکل جامع برای آماده‌سازی اسلاید بافت قشر پیش‌پیشانی انسان فیکس شده در فرمالین و درج شده در پارافین برای استفاده در سیستم GeoMx DSP ارائه می‌دهد. هدف این پروتکل، مشخصات مکانی نورون‌های مورفی‌شامل اختصاصی لامینا در ناحیه برودمان ۹ است. این روش به طور خاص برای توالی‌یابی رنا از حدود ۲۰ نورون مورفی‌شکل طراحی شده است.

  • پروفایل‌برداری فضایی دیجیتال (DSP) برای توالی‌یابی رنا از نورون‌های مورفی‌شکل در بافت مغز انسان پس از مرگ استفاده می‌شود.
  • پروتکل ارائه شده برای آماده‌سازی اسلاید با استفاده از سیستم GeoMx DSP است.
  • نورون‌های مورفی‌شامل اختصاصی لامینا در ناحیه برودمان ۹ هدف پروفایل‌برداری هستند.
  • تکنیک به طور خاص برای تحلیل حدود ۲۰ نورون مورفی‌شکل طراحی شده است.

ترجمه فارسی چکیده

پروفایل‌برداری فضایی دیجیتال (DSP) امکان توالی‌یابی رنا (RNA-seq) از جمعیت‌های سلولی کوچک، به‌ویژه حدود ۲۰ نورون مورفی‌شکل در بافت مغز انسان فیکس شده در فرمالین و درج شده در پارافین (FFPE) پس از مرگ را فراهم می‌کند. این رویکرد امکان پروفایل‌برداری دقیق بیان از طریق داده‌های RNA-seq که به نمونه‌های مشخص شده مکانی با استفاده از سنجاق‌های متصل به بافت متصل می‌شوند، را فراهم می‌کند. ما یک پروتکل جامع برای آماده‌سازی دستی اسلاید با استفاده از سیستم GeoMx DSP به عنوان مراحل اولیه برای مشخصات مکانی نورون‌های مورفی‌شامل اختصاصی لامینا در بافت قشر پیش‌پیشانی انسان پس از مرگ ناحیه برودمان ۹ (BA9) ارائه می‌دهیم.

روش پژوهش

پروتکل شامل آماده‌سازی دستی اسلاید با استفاده از سیستم GeoMx DSP است.

محدودیت‌ها

محدودیت‌ها در متن گزارش نشده‌اند.

استخراج ساختاریافته از متن منبع

نمای PICO و پیامدها

جمعیت
بافت مغز انسان پس از مرگ (ناحیه برودمان ۹)
مداخله/مواجهه
پروفایل‌برداری فضایی دیجیتال (DSP) و GeoMx DSP
مقایسه
مورد مقایسه گزارش نشده است.
حجم نمونه
تعداد نمونه در متن گزارش نشده است.

متن کامل اصلی

متن در JumpToDate ذخیره نشده است.

برای بررسی دسترسی کتابخانه‌ای یا خرید، رکورد اصلی را باز کنید.

رفتن به منبع اصلی

کلیدواژه‌ها

CaMKII-αDigital spatial profilingFFPEFrontal cortexIn situ hybridizationPyramidal neuronsRNA-seq
در همین زیرشاخه

مقاله‌های مرتبط

PubMed2027

A Defined Strategy for Multi-Lineage Differentiation of Gastric Organoids.

In the gastric glands, adult stem cells differentiate into multiple epithelial lineages, including pit mucous cells, acid-secreting parietal cells, and enzyme-producing chief cells. Efficient and controllable lineage specification from adult gastric stem cells is essential for modeling gastric homeostasis and disease in vitro. Organoids are a good model for investigating cell differentiation and organ formation. However, methods to ach…

PubMed2027

A Standardized Protocol for Generating iPSC-Derived Human Microglia for Functional Genomic Assays.

Human induced pluripotent stem cell (iPSC)-derived microglia (iMG) provide an in vitro experimental system for studying human microglial biology, neuroinflammation, and genetic risk mechanisms associated with neurological disease. This chapter describes a standardized, scalable, and reproducible protocol for the differentiation of human iPSCs into functional microglia-like cells, with particular emphasis on applications in transcriptio…

PubMed2027

Alkaline Phosphatase Staining of Embryonic Stem Cells.

Alkaline phosphatase (AP) is a widely utilized histochemical marker for assessing the pluripotent state of embryonic stem (ES) cells. Mouse ES cells maintained in an undifferentiated state exhibit high levels of tissue-nonspecific alkaline phosphatase (TNAP) activity, which sharply declines upon differentiation. AP staining provides a rapid, cost-effective, and reliable method to evaluate ES cell colony morphology, confirm maintenance …

PubMed2027

An Electroporation-Based Protocol for Ex Vivo Base Editing: From Design to Quantitative Assessment.

Base editing is a CRISPR variant approach that enables single-nucleotide conversions without generating double-strand breaks. Cytosine and adenine base editors mediate C•G to T•A and A•T to G•C transitions, respectively, by coupling a deaminase to a catalytically impaired Cas9, a modified nuclease that lacks DNA cleavage activity but retains DNA binding capability. By avoiding double-strand breaks, base editing limits reliance on unpre…