PubMed دسترسی آزاد

Functional characterization of SHC-like triterpene cyclase genes in azole response and virulence-related traits of Aspergillus fumigatus.

استودیوی صوتی مقاله

پخش حرفه‌ای فارسی و انگلیسی

در حال بررسی نسخه‌های صوتی ذخیره‌شده…

صوت تولیدشده با هوش مصنوعی است. برای کاربرد علمی یا درمانی، متن و منبع اصلی را بررسی کنید.
خواندن هوشمند فارسی و انگلیسی در حال آماده‌سازی صداهای مرورگر…
تنظیم صدای طبیعی و سرعت

صداهایی که در نامشان «Natural»، «Neural» یا «Online» دیده می‌شود معمولاً طبیعی‌ترند. انتخاب صدا به صداهای نصب‌شده در ویندوز و مرورگر شما بستگی دارد.

چکیده اصلی

Aspergillus fumigatus is a major opportunistic fungal pathogen, and increasing azole resistance poses a challenge for aspergillosis treatment. Squalene is an upstream precursor of ergosterol biosynthesis and may also be utilized by SHC-like triterpene cyclases, suggesting a potential link between squalene-associated metabolism, membrane adaptation, and azole response. However, the roles of SHC-like triterpene cyclase genes in A. fumigatus remain unclear. Here, we characterized three candidates, shc1, shc2, and shc3, using comparative bioinformatic analysis, gene deletion, phenotypic assays, azole susceptibility testing, transcriptomics, and host-interaction models. Sequence, genomic-context, phylogenetic, and structural analyses suggested divergence among the three candidates. Individual shc deletion caused limited effects on vegetative growth, whereas loss of shc1 mildly reduced susceptibility to voriconazole and posaconazole, as reflected by twofold MIC increases and lower inhibition rates. Transcriptomic analysis revealed distinct remodeling patterns, with Δshc3 showing the broadest transcriptional changes despite no detectable MIC shift. Targeted metabolite profiling and PI uptake analysis further supported an association between shc deletion, sterol/hopane-type triterpenoid balance, and membrane-associated properties. shc deletion also altered epithelial cell interaction phenotypes, while Δshc1 showed reduced lethality in Galleria mellonella. In clinical isolates, elevated shc transcription was associated with azole-resistant backgrounds. These findings suggest functional diversification among SHC-like triterpene cyclase genes and indicate that shc1 may contribute to azole-associated adaptation and virulence-related traits in A. fumigatus.

نتیجه فارسی

ژن‌های سیکلایز تری‌ترپن‌مانند SHC در قارچ آسپرژیلوس فومگاتاتوس نقش‌های متفاوتی دارند. حذف shc1 حساسیت به برخی داروهای ضدقارچ را کاهش می‌دهد. حذف shc3 تغییرات ترنسکریپتونی گسترده‌ای ایجاد می‌کند. این ژن‌ها با تعادل استرول و ویژگی‌های غشایی مرتبط هستند. افزایش ترنسکریپشن shc در ایزول‌های بالینی با مقاومت به ایزول مرتبط است.

  • سه ژن shc1، shc2 و shc3 در A. fumigatus شناسایی و بررسی شدند.
  • حذف shc1 حساسیت به وروکونازول و پوزاکونازول را کاهش داد.
  • Δshc3 تغییرات ترنسکریپتونی گسترده‌ای ایجاد کرد.
  • حذف shc با تعادل استرول و ویژگی‌های غشایی مرتبط است.
  • ترنسکریپشن shc در ایزول‌های بالینی مقاوم به ایزول افزایش یافت.

ترجمه فارسی چکیده

آسپرژیلوس فومگاتوس یک عامل بیماری‌زای قارچی شایع است و افزایش مقاومت به ایزول چالشی برای درمان آسپرژیلوز ایجاد کرده است. اسکوالن پیش‌ساز بالادستی بیوسنتز استرول است و ممکن است توسط سیکلایزهای تری‌ترپن‌مانند SHC استفاده شود که نشان‌دهنده یک پیوند بالقوه بین متابولیسم مرتبط با اسکوالن، سازگاری غشایی و پاسخ به ایزول است. نقش ژن‌های سیکلایز تری‌ترپن‌مانند SHC در A. fumigatus هنوز مشخص نیست. در اینجا سه نامزد، shc1، shc2 و shc3، با استفاده از تحلیل بیوانفورماتیک مقایسه‌ای، حذف ژن، آزمون‌های فنوتیپی، تست حساسیت به ایزول، ترنسکریپتومیک و مدل‌های تعامل میزبان تعیین شدند. تحلیل‌های توالی، زمینه ژنومیک، فیلوژنتیک و ساختاری نشان‌دهنده تفاوت‌های بین سه نامزد بود. حذف فردی shc اثرات محدودی بر رشد گیاهی داشت، در حالی که از دست دادن shc1 حساسیت به وروکونازول و پوزاکونازول را به‌طور ملایم کاهش داد که با افزایش دو برابری میک و نرخ‌های کاهشی کمتر منعکس شد. تحلیل ترنسکریپتومیک الگوهای بازسازی متفاوتی را آشکار کرد، با اینکه Δshc3 بیشترین تغییرات ترنسکریپتونی را نشان داد با وجود اینکه هیچ تغییر میک مشاهده نشد. پروفایل متابولیتی هدفمند و تحلیل جذب PI همچنین یک ارتباط بین حذف shc، تعادل استرول/تریتروپنوئید نوع هپان و ویژگی‌های مرتبط با غشایی را پشتیبانی کردند. حذف shc همچنین الگوهای فنوتیپی تعامل با سلول‌های اپیتلیال را تغییر داد، در حالی که Δshc1 در گالریا مِلونلا (Galleria mellonella) مرگ‌بارتر بود. در ایزول‌های بالینی، افزایش ترنسکریپشن shc با زمینه‌های مقاوم به ایزول مرتبط بود. این یافته‌ها نشان‌دهنده تفاوت‌های عملکردی بین ژن‌های سیکلایز تری‌ترپن‌مانند SHC هستند و نشان می‌دهند که shc1 ممکن است به سازگاری مرتبط با ایزول و ویژگی‌های مرتبط با ویروسیس در A. fumigatus کمک کند.

روش پژوهش

تحلیل‌های بیوانفورماتیک مقایسه‌ای، حذف ژن، آزمون‌های فنوتیپی، تست حساسیت به ایزول، تحلیل ترنسکریپتومیک و مدل‌های تعامل میزبان انجام شد.

محدودیت‌ها

محدودیت‌های گزارش نشده‌اند.

استخراج ساختاریافته از متن منبع

نمای PICO و پیامدها

جمعیت
قارچ آسپرژیلوس فومگاتاتوس (A. fumigatus)
مداخله/مواجهه
حذف ژن‌های shc1، shc2 و shc3
مقایسه
نامزد (wild-type) و ایزول‌های بالینی
حجم نمونه
تعداد نمونه مشخص نشده است.

متن کامل اصلی

نسخه دارای مجوز در منبع علمی در دسترس است.

لینک مستقیم از metadata منبع گرفته شده و در تب جدید باز می‌شود.

باز کردن متن کامل

کلیدواژه‌ها

Aspergillus fumigatusSHC-like triterpene cyclaseazole susceptibilitysqualenetranscriptomic remodelingvirulence-related traits
در همین زیرشاخه

مقاله‌های مرتبط

PubMed2027

A Defined Strategy for Multi-Lineage Differentiation of Gastric Organoids.

In the gastric glands, adult stem cells differentiate into multiple epithelial lineages, including pit mucous cells, acid-secreting parietal cells, and enzyme-producing chief cells. Efficient and controllable lineage specification from adult gastric stem cells is essential for modeling gastric homeostasis and disease in vitro. Organoids are a good model for investigating cell differentiation and organ formation. However, methods to ach…

PubMed2027

A Standardized Protocol for Generating iPSC-Derived Human Microglia for Functional Genomic Assays.

Human induced pluripotent stem cell (iPSC)-derived microglia (iMG) provide an in vitro experimental system for studying human microglial biology, neuroinflammation, and genetic risk mechanisms associated with neurological disease. This chapter describes a standardized, scalable, and reproducible protocol for the differentiation of human iPSCs into functional microglia-like cells, with particular emphasis on applications in transcriptio…

PubMed2027

Alkaline Phosphatase Staining of Embryonic Stem Cells.

Alkaline phosphatase (AP) is a widely utilized histochemical marker for assessing the pluripotent state of embryonic stem (ES) cells. Mouse ES cells maintained in an undifferentiated state exhibit high levels of tissue-nonspecific alkaline phosphatase (TNAP) activity, which sharply declines upon differentiation. AP staining provides a rapid, cost-effective, and reliable method to evaluate ES cell colony morphology, confirm maintenance …

PubMed2027

An Electroporation-Based Protocol for Ex Vivo Base Editing: From Design to Quantitative Assessment.

Base editing is a CRISPR variant approach that enables single-nucleotide conversions without generating double-strand breaks. Cytosine and adenine base editors mediate C•G to T•A and A•T to G•C transitions, respectively, by coupling a deaminase to a catalytically impaired Cas9, a modified nuclease that lacks DNA cleavage activity but retains DNA binding capability. By avoiding double-strand breaks, base editing limits reliance on unpre…