PubMed چکیده/رکورد

Topic-Driven Bibliometrics and Trend Intelligence for Stem Cell and Cancer Research.

استودیوی صوتی مقاله

پخش حرفه‌ای فارسی و انگلیسی

در حال بررسی نسخه‌های صوتی ذخیره‌شده…

صوت تولیدشده با هوش مصنوعی است. برای کاربرد علمی یا درمانی، متن و منبع اصلی را بررسی کنید.
خواندن هوشمند فارسی و انگلیسی در حال آماده‌سازی صداهای مرورگر…
تنظیم صدای طبیعی و سرعت

صداهایی که در نامشان «Natural»، «Neural» یا «Online» دیده می‌شود معمولاً طبیعی‌ترند. انتخاب صدا به صداهای نصب‌شده در ویندوز و مرورگر شما بستگی دارد.

چکیده اصلی

The rapid growth of biomedical literature has created an urgent need for computational tools that enable researchers to systematically analyze publication trends, identify emerging research themes, and map the evolution of scientific fields. PubMed Atlas is a command-line and web-enabled workflow for topic-driven bibliometrics and trend intelligence using PubMed E-utilities. The pipeline executes PubMed queries, retrieves matching PMIDs, downloads full metadata records in batches, parses structured information (title, abstract, authors/affiliations, MeSH terms, publication types, grants, keywords, DOI), and stores normalized data in a local SQLite database for rapid querying and visualization. A Streamlit dashboard provides interactive exploration of publication trends, journal distributions, MeSH term summaries, geographic distributions, and recent article browsing with direct PubMed links. This protocol describes the installation, configuration, and operation of PubMed Atlas for cancer stem cell and stem cell transcriptional network research, and other fields, enabling investigators to conduct reproducible bibliometric analyses and identify knowledge gaps in rapidly evolving fields.

نتیجه فارسی

PubMed Atlas یک ابزار جریان کار برای تحلیل کتابشناختی و هوش‌مندی روند است که از ابزارهای E-utilities PubMed استفاده می‌کند. این ابزار داده‌های متادیتا را استانداردسازی کرده و در یک پایگاه داده SQLite ذخیره می‌کند و یک داشبورد تعاملی برای نمایش روند انتشارها و توزیع‌ها فراهم می‌کند. این پروتکل نحوه استفاده از این ابزار را برای تحقیقات سلول بنیادی سرطان توصیف می‌کند.

  • PubMed Atlas یک ابزار جریان کار مبتنی بر خط فرمان و تحت وب برای تحلیل کتابشناختی است.
  • این ابزار داده‌های متادیتا را از PubMed استخراج و استانداردسازی می‌کند.
  • داشبورد Streamlit امکان کاوش تعاملی داده‌ها را فراهم می‌کند.
  • این پروتکل برای تحقیقات سلول بنیادی سرطان و سایر حوزه‌ها قابل استفاده است.

ترجمه فارسی چکیده

رشد سریع ادبیات زیست‌پزشکی نیاز فوری به ابزارهای محاسباتی ایجاد کرده است که به محققان اجازه می‌دهد به طور سیستماتیک روند انتشارها را تحلیل کنند، موضوعات تحقیقاتی نوظهور را شناسایی کنند و تکامل علوم را ترسیم کنند. PubMed Atlas یک جریان کار مبتنی بر خط فرمان و تحت وب برای مطالعات کتابشناختی و هوش‌مندی روند مبتنی بر موضوع با استفاده از ابزارهای E-utilities PubMed است. این خط لوله پرس‌وجوهای PubMed را اجرا می‌کند، شناسه‌های PMIDs مطابق را بازیابی می‌کند، رکوردهای کامل متادیتا را به صورت دسته‌ای دانلود می‌کند، اطلاعات ساختاریافته (عنوان، چکیده، نویسندگان/وابستگی‌ها، اصطلاحات MeSH، انواع انتشار، کمک‌هزینه‌ها، کلمات کلیدی، DOI) را تجزیه می‌کند و داده‌های استانداردسازی شده را در یک پایگاه داده SQLite محلی برای پرس‌وجوی سریع و نمایش‌گرایی ذخیره می‌کند. یک داشبورد Streamlit امکان کاوش تعاملی در روند انتشارها، توزیع ژورنال‌ها، خلاصه‌های اصطلاح MeSH، توزیع‌های جغرافیایی و مرور مقالات اخیر با لینک‌های مستقیم PubMed را فراهم می‌کند. این پروتکل نصب، پیکربندی و عملکرد PubMed Atlas برای تحقیقات سلول بنیادی سرطان و شبکه‌های ترنسکریپتional سلول بنیادی و سایر حوزه‌ها را توصیف می‌کند و به محققان امکان انجام تحلیل‌های کتابشناختی قابل تکرار و شناسایی شکاف‌های دانش در حوزه‌های در حال تکامل سریع را می‌دهد.

روش پژوهش

این پروتکل شامل نصب، پیکربندی و عملکرد PubMed Atlas است که از ابزارهای E-utilities PubMed برای استخراج و استانداردسازی داده‌ها استفاده می‌کند.

محدودیت‌ها

محدودیت‌های این پروتکل در متن گزارش نشده است.

استخراج ساختاریافته از متن منبع

نمای PICO و پیامدها

جمعیت
مطالعات کتابشناختی و تحقیقات سلول بنیادی سرطان.
مداخله/مواجهه
استفاده از PubMed Atlas برای تحلیل کتابشناختی.
مقایسه
مورد مقایسه قرار نگرفته است.
حجم نمونه
تعداد نمونه گزارش نشده است.

متن کامل اصلی

متن در JumpToDate ذخیره نشده است.

برای بررسی دسترسی کتابخانه‌ای یا خرید، رکورد اصلی را باز کنید.

رفتن به منبع اصلی

کلیدواژه‌ها

BibliometricsCancer stem cellsComputational biologyE-utilitiesLiterature miningPubMedSQLiteStem cellsStreamlitTrend analysis
در همین زیرشاخه

مقاله‌های مرتبط

PubMed2027

Computational Network Analysis for Defining Transcriptional Programs.

Cancer cell identity is governed by coordinated transcriptional programs that are frequently rewired during tumorigenesis. Systematic identification of cancer type-specific gene regulatory networks provides a framework for understanding oncogenic state transitions and for prioritizing candidate therapeutic targets. Here, we present a reproducible network-based workflow for reconstructing and analyzing transcriptional regulatory program…

PubMed2026

Nursing Students' Reports of Patient Safety Incidents and Reasons During Clinical Placements: A Secondary Analysis of the International Data.

Clinical placements expose nursing students to patient safety incidents and provide important opportunities for learning about safe care. This study explored how nursing students in four countries recognized and interpreted patient safety incidents encountered or witnessed during clinical practice, including perceived contributing factors. A secondary qualitative content analysis was conducted using narrative data from 1442 undergradua…

PubMed2026

Frequency of Clinically Relevant Drug-Drug Interactions Between Tyrosine Kinase Inhibitors and Proton Pump Inhibitors in Patients With Cancer Using Real-World Data.

BACKGROUND: Proton pump inhibitors (PPIs) raise stomach pH, leading to reduced bioavailability of many tyrosine kinase inhibitors (TKIs), thereby affecting treatment outcomes. To what extent this interaction occurs in clinical practice remains underexplored. OBJECTIVE: To determine the frequency of clinically relevant interactions between TKIs and PPIs in clinical practice and the duration of concomitant prescription. METHODS: A retros…

PubMed2026

Mechanisms of Quyu tong-bi decoction for the treatment of type III prostatitis - based on database and in-vitro experiments.

BACKGROUND: Quyu tong-bi decoction (QYTB) has demonstrated significant clinical efficacy in treating type III prostatitis. However, its underlying pharmacological mechanisms remain to be fully elucidated. OBJECTIVES: This study aimed to investigate the molecular mechanisms by which QYTB addresses type III prostatitis by integrating network pharmacology, molecular docking and experimental validation. METHODS: Active ingredients and pote…