Proteomic profiling of cephalic vein reveals potential biomarkers for arteriovenous fistula neointimal hyperplasia in ESRD patients.
پخش حرفهای فارسی و انگلیسی
در حال بررسی نسخههای صوتی ذخیرهشده…
تنظیم صدای طبیعی و سرعت
صداهایی که در نامشان «Natural»، «Neural» یا «Online» دیده میشود معمولاً طبیعیترند. انتخاب صدا به صداهای نصبشده در ویندوز و مرورگر شما بستگی دارد.
چکیده اصلی
Arteriovenous fistula (AVF) is the preferred vascular access for patients with end-stage renal disease; however, its failure is primarily due to neointimal hyperplasia. Five patients who underwent initial AVF surgery served as the control group, and another five patients with failed AVF surgery served as the experimental group. Herein, we employed mass spectrometry (MS)-based quantitative proteomics coupled with tandem mass tag labeling to screen differentially expressed proteins (DEPs) in the anastomotic cephalic vein, followed by bioinformatics analyses and verification experiments. A total of 121 DEPs were identified in the failed AVF group. GO analysis was primarily enriched in protein binding, nucleic acid binding, enzyme binding, mRNA binding, cadherin binding, catalytic activity, and cell adhesion molecule binding. KEGG pathways were mainly enriched in cell aggregation and adhesion, actin cytoskeleton, extracellular matrix-receptor interaction, PI3K-Akt signaling pathway, complement and coagulation cascades, and cholesterol metabolism. Protein-protein interaction network consisted of 86 (71.07%) DEPs, including complement VII (C7), factor IX (F9), SERPINC1, microfibril-associated glycoprotein 4 (MFAP4), complement C1s subcomponent, complement C1q subcomponent subunit A, complement C1q subcomponent subunit B, tissue factor, and von Willebrand factor, which interacting with numerous other proteins. In the expanded validation for different patients, C7, F9, SERPINC1, and MFAP4, were verified by immunohistochemical staining and Western blotting, which were consistent with the proteomics results. Collectively, this study identifies a series of potential diagnostic biomarkers, and explores the underlying mechanisms associated with AVF dysfunction.
نتیجه فارسی
این مطالعه با استفاده از پروتئومیک، پروتئینهای بیانشده متفاوتی را در سیاهرگ سمت جمجمه بیماران با شکست شریان-وریدی (AVF) نسبت به بیماران موفق شناسایی کرد. تحلیلهای بیوانفورماتیک نشان داد که مسیرهای مرتبط با اتصال سلولی و تعامل ماتریس خارج سلولی نقش مهمی دارند. چهار پروتئین (C7، F9، SERPINC1 و MFAP4) در تاییدیههای بعدی تأیید شدند.
- پروتئینهای بیانشده متفاوت (DEPs) در سیاهرگ اتصالی بیماران با شکست AVF شناسایی شدند.
- تحلیلهای GO و KEGG مسیرهای اتصال سلولی و متابولیسم کلسترول را نشان دادند.
- شبکه تعامل پروتئین-پروتئین شامل پروتئینهای کمپلمنت و فاکتور وون ویلبراند بود.
- C7، F9، SERPINC1 و MFAP4 با روشهای ایمونوهیستوشیمی و وسترن بلات تأیید شدند.
ترجمه فارسی چکیده
شریان-وریدی (AVF) به عنوان روش دسترسی عروقی ترجیحی برای بیماران نارسایی کلیه در نظر گرفته میشود، اما شکست آن عمدتاً به دلیل هیپرپلازی نئواینتیمال است. پنج بیمار که جراحی AVF اولیه را انجام داده بودند به عنوان گروه کنترل و پنج بیمار دیگر با شکست جراحی AVF به عنوان گروه آزمایشی در نظر گرفته شدند. در اینجا، ما از پروتئومیک کمی مبتنی بر اسپکترومسنجی جرمی (MS) همراه با برچسبگذاری تگ جرمی دنبالهای برای غربالگری پروتئینهای بیانشده متفاوت (DEPs) در سیاهرگ سمت جمجمه اتصالی استفاده کردیم، که به دنبال آن تحلیلهای بیوانفورماتیک و آزمایشهای تأییدی قرار داشت. مجموعاً ۱۲۱ DEP در گروه AVF شکستخورده شناسایی شد. تحلیل GO عمدتاً در اتصال پروتئین، اتصال اسید نوکلئیک، اتصال آنزیم، اتصال mRNA، اتصال کادهرین، فعالیت کاتالیتیک و اتصال مولکول اتصال سلول غنی شد. مسیرهای KEGG عمدتاً در تجمع و اتصال سلولی، سیتوسیلکوتاکسین اکتیین، تعامل ماتریس خارج سلولی-گیرنده، مسیر سیگنالینگ PI3K-Akt، زنجیرههای کمپلمنت و انعقاد و متابولیسم کلسترول غنی شدند. شبکه تعامل پروتئین-پروتئین شامل ۸۶ (۷۱.۰۷٪) DEP بود، شامل کمپلمنت هفت (C7)، فاکتور نهم (F9)، SERPINC1، گلیکوپروتئین مرتبط با میکروفیبریل ۴ (MFAP4)، زیرمولکول کمپلمنت C1s، زیرمولکول کمپلمنت C1q زیرمولکول A، زیرمولکول کمپلمنت C1q زیرمولکول B، فاکتور بافت و فاکتور وون ویلبراند، که با بسیاری از پروتئینهای دیگر تعامل داشتند. در تاییدیه گسترده برای بیماران مختلف، C7، F9، SERPINC1 و MFAP4 با رنگآمیزی ایمونوهیستوشیمی و وسترن بلات تأیید شدند که با نتایج پروتئومیک همخوانی داشتند. در مجموع، این مطالعه مجموعهای از نشانگرهای بالقوه تشخیصی را شناسایی میکند و مکانیسمهای زیربنایی مرتبط با عملکرد نامناسب AVF را بررسی میکند.
روش پژوهش
این مطالعه از اسپکترومسنجی جرمی (MS) مبتنی بر برچسبگذاری تگ جرمی دنبالهای برای غربالگری پروتئینها استفاده کرد. تحلیلهای بیوانفورماتیک (GO و KEGG) و آزمایشهای تأییدی (ایمونوهیستوشیمی و وسترن بلات) انجام شد.
محدودیتها
محدودیتهای این مطالعه شامل تعداد کوچک نمونه (پنج بیمار در هر گروه) و ماهیت تجربی آن است.
نمای PICO و پیامدها
- جمعیت
- بیماران مبتلا به نارسایی کلیه در مراحل نهایی (ESRD) که تحت جراحی AVF قرار گرفته بودند.
- مداخله/مواجهه
- پروفایلبرداری پروتئومیک از سیاهرگ سمت جمجمه اتصالی.
- مقایسه
- سیاهرگ سمت جمجمه اتصالی در بیماران با AVF موفق.
- حجم نمونه
- پنج بیمار در گروه کنترل و پنج بیمار در گروه آزمایشی.
متن کامل اصلی
لینک مستقیم از metadata منبع گرفته شده و در تب جدید باز میشود.
باز کردن متن کامل