PubMed چکیده/رکورد

High-Throughput Sample Preparation for Plant (Phospho) Proteomics.

Mark Roosjen, Dolf Weijers• 2027• Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
استودیوی صوتی مقاله

پخش حرفه‌ای فارسی و انگلیسی

در حال بررسی نسخه‌های صوتی ذخیره‌شده…

صوت تولیدشده با هوش مصنوعی است. برای کاربرد علمی یا درمانی، متن و منبع اصلی را بررسی کنید.
خواندن هوشمند فارسی و انگلیسی در حال آماده‌سازی صداهای مرورگر…
تنظیم صدای طبیعی و سرعت

صداهایی که در نامشان «Natural»، «Neural» یا «Online» دیده می‌شود معمولاً طبیعی‌ترند. انتخاب صدا به صداهای نصب‌شده در ویندوز و مرورگر شما بستگی دارد.

چکیده اصلی

Mass spectrometry-based proteomics allows the unbiased identification and quantification of proteins and phosphopeptides in biological materials. The nature of walled plant cells requires specific protocols for effective and efficient protein isolation, and, in general, the plant sciences can benefit from more accessible, optimized proteomics workflows. Advances in MS instrumentation now allow the measurement of large numbers of samples, shifting constraints in proteomics toward the accurate, high-throughput preparation of samples. Here, we describe a high-throughput (phospho)proteomics protocol that enables processing of samples using different filter types in a 96-well format.

نتیجه فارسی

این مقاله یک پروتکل پروتئومیک (فسفو) با ظرفیت بالا را برای نمونه‌های گیاهی توصیف می‌کند که در قالب ۹۶ لوله و با استفاده از انواع فیلترها اجرا می‌شود. این روش به دلیل نیاز به جداسازی مؤثر پروتئین‌ها از سلول‌های دیواره‌دار گیاهی طراحی شده است. پیشرفت‌های طیف‌سنجی جرمی امکان پردازش تعداد زیادی نمونه را فراهم کرده است.

  • پروتکل برای نمونه‌های گیاهی با دیواره سلولی طراحی شده است.
  • پردازش نمونه‌ها در قالب ۹۶ لوله انجام می‌شود.
  • استفاده از انواع فیلترها در روش توصیف شده است.
  • هدف افزایش کارایی و دسترسی به پروتئومیک در علوم گیاهی است.

ترجمه فارسی چکیده

پروتئومیک مبتنی بر طیف‌سنجی جرمی امکان شناسایی و کمی‌سازی بی‌طرف پروتئین‌ها و پپتیدهای فسفری را در مواد زیستی فراهم می‌کند. ماهیت سلول‌های گیاهی دیواره‌دار نیاز به پروتکل‌های خاصی برای جداسازی مؤثر و کارآمد پروتئین‌ها دارد و به طور کلی علوم گیاهی از کاربردهای بهتر و بهینه‌تر پروتئومیک بهره می‌برند. پیشرفت‌های در تجهیزات طیف‌سنجی جرمی اکنون امکان اندازه‌گیری تعداد زیادی نمونه را فراهم کرده است و محدودیت‌های پروتئومیک را به سمت آماده‌سازی دقیق و با ظرفیت بالا نمونه‌ها منتقل کرده است. در اینجا، ما یک پروتکل پروتئومیک (فسفو) با ظرفیت بالا را توصیف می‌کنیم که امکان پردازش نمونه‌ها با استفاده از انواع فیلترها در قالب ۹۶ لوله را فراهم می‌کند.

روش پژوهش

پروتکل توصیف شده برای نمونه‌های گیاهی با دیواره سلولی طراحی شده و در قالب ۹۶ لوله اجرا می‌شود.

محدودیت‌ها

محدودیت‌های روش به طور کامل در متن گزارش نشده‌اند.

استخراج ساختاریافته از متن منبع

نمای PICO و پیامدها

جمعیت
سلول‌های گیاهی با دیواره سلولی
مداخله/مواجهه
پروتکل آماده‌سازی نمونه با ظرفیت بالا (فسفو) پروتئومیک
مقایسه
نامشخص
حجم نمونه
نامشخص

متن کامل اصلی

متن در JumpToDate ذخیره نشده است.

برای بررسی دسترسی کتابخانه‌ای یا خرید، رکورد اصلی را باز کنید.

رفتن به منبع اصلی

کلیدواژه‌ها

High-throughputPhosphoproteomicsPlant proteomicsSuspension trapping
در همین زیرشاخه

مقاله‌های مرتبط

PubMed2027

A Modelling Approach to Resolve Gene Temporal Dynamics in Intestinal Inflammation.

The intestinal epithelium is maintained by stem cells at the crypt base, however, acute or chronic inflammation can severely disrupt stem cell function and tissue homeostasis. To characterize mucosal inflammation and tissue damage, we evaluated time-course gene expression changes using a dextran sulfate sodium (DSS)-induced mouse model of colitis. By applying normalization, Z-score transformation, and spline curve modeling, we trace th…

PubMed2027

A Standardized Protocol for Generating iPSC-Derived Human Microglia for Functional Genomic Assays.

Human induced pluripotent stem cell (iPSC)-derived microglia (iMG) provide an in vitro experimental system for studying human microglial biology, neuroinflammation, and genetic risk mechanisms associated with neurological disease. This chapter describes a standardized, scalable, and reproducible protocol for the differentiation of human iPSCs into functional microglia-like cells, with particular emphasis on applications in transcriptio…

PubMed2027

B-Cell Aware Analysis of Single-Cell Transcriptomics Data.

Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) has facilitated the studies of cellular heterogeneity in many different biological contexts, including how B cells function and mediate immune responses to infection, malignancies, and autoimmunity. scRNA-seq as applied to B cells requires specific bioinformatics strategies, which consider the distinct biology of B cells and biological processes unique to these cells, such as somatic hypermutation…

PubMed2027

Combined Lipidomic and Metabolomic Analyses on Cardiac Organoids.

Cardiac organoids are increasingly used to model human cardiac development and disease, but their small size often limits molecular characterization, especially if different approaches and protocols are necessary to extract and quantify metabolites and lipids. Here, we present a multistep workflow for combined targeted free amino-acid (FAA) based metabolomic and lipidomic profiling from a single pooled cardiac organoid sample. The prot…