PubMed دسترسی آزاد

Quantitative and amino acid sequence analysis of soluble HIV-1 Vpu and calmodulin interactions.

استودیوی صوتی مقاله

پخش حرفه‌ای فارسی و انگلیسی

در حال بررسی نسخه‌های صوتی ذخیره‌شده…

صوت تولیدشده با هوش مصنوعی است. برای کاربرد علمی یا درمانی، متن و منبع اصلی را بررسی کنید.
خواندن هوشمند فارسی و انگلیسی در حال آماده‌سازی صداهای مرورگر…
تنظیم صدای طبیعی و سرعت

صداهایی که در نامشان «Natural»، «Neural» یا «Online» دیده می‌شود معمولاً طبیعی‌ترند. انتخاب صدا به صداهای نصب‌شده در ویندوز و مرورگر شما بستگی دارد.

چکیده اصلی

HIV-1 Vpu supports viral adaptation through host-protein interactions. Although mainly membrane-associated, we recently identified a soluble Vpu form that forms a stable complex with Ca2+-bound calmodulin (Ca2+-CaM), potentially influencing Vpu trafficking. Here, to determine the binding affinity and identify regions of soluble Vpu involved in CaM binding, we used ensemble Förster resonance energy transfer (eFRET). We tested Cy3-labeled full-length (FL) Vpu, a C-terminal fragment (helices 2 and 3), and a Cy3-labeled FL Vpu V22A/W23Y/I33N mutant with substitutions of key residues in Vpu's helix 1 and helices 1-to-2 loop having a role in the interaction with Ca2+-CaM. All Vpu variants were labeled at residue L42C. Ca2+-CaM was tagged with Cy5 at residue S39C. eFRET analysis of 100 nM Cy3-Vpu variants mixed with Cy5-Ca2+-CaM (in the range 100 nM-2.5 μM) revealed heterocomplexes formation with characteristic dissociation constants (Kd) and binding free energies (∆G). FL Vpu-Ca2+-CaM showed highest stability (Kd ~74 nM, ∆G ~-9.7 kcal/mol), while the truncated C-terminal region and V22A/W23Y/I33N mutant formed weaker complexes with Ca2+-CaM (Kd~182 nM and 800 nM, ∆G ~-9.2 kcal/mol and ~-8.3 kcal/mol). The reduced Vpu-Ca2+-CaM stability after disruption of binding sites in and near Vpu helix 1 may explain how this interaction is regulated, including through lipid competition that promotes Vpu membrane insertion. We propose that, at the membrane, hydrophobic helix 1 dissociates from Ca2+-CaM and inserts into the lipid bilayer, weakening the complex and releasing CaM. These findings clarify HIV-1 Vpu interactions with cellular components and may inform antiviral development.

نتیجه فارسی

این مطالعه با استفاده از eFRET، قدرت پیوند HIV-1 Vpu با کال‌مودولین یونیزه شده با کلسیم را اندازه‌گیری کرد. فرم کامل Vpu بیشترین پایداری را نشان داد، در حالی که تغییرات در هلیکس ۱ و حلقه‌های آن منجر به پیوندهای ضعیف‌تر شدند. این یافته‌ها نشان می‌دهد که تعامل Vpu با CaM در غشا تحت کنترل قرار می‌گیرد.

  • eFRET برای تعیین Kd و ∆G پیوند Vpu با Ca2+-CaM استفاده شد.
  • FL Vpu بیشترین پایداری را با Kd ~74 nM نشان داد.
  • مولتی‌نوکلئوتید V22A/W23Y/I33N پیوندی ضعیف‌تر با Kd ~800 nM ایجاد کرد.
  • هلیکس ۱ Vpu نقش کلیدی در تعامل با CaM دارد.
  • تضعیف پیوند در غشا ممکن است به آزادسازی CaM کمک کند.

ترجمه فارسی چکیده

HIV-1 Vpu از طریق تعامل با پروتئین‌های میزبان، سازگاری ویروسی را پشتیبانی می‌کند. اگرچه عمدتاً به غشا متصل است، ما اخیراً یک فرم محلول Vpu را شناسایی کردیم که با کال‌مودولین یونیزه شده با کلسیم (Ca2+-CaM) پیوند پایداری تشکیل می‌دهد که ممکن است بر مسیر یابی Vpu تأثیر بگذارد. برای تعیین قدرت پیوند و شناسایی مناطق فرعی Vpu درگیر در پیوند با CaM، از روش eFRET استفاده شد. تحلیل eFRET نشان داد که FL Vpu بیشترین پایداری را با Ca2+-CaM نشان داد (Kd ~74 nM)، در حالی که قطعه C-ترمینال و مولتی‌نوکلئوتید V22A/W23Y/I33N پیوندهای ضعیف‌تری تشکیل دادند. ما پیشنهاد می‌کنیم که در غشا، هلیکس ۱ آبدوست از Ca2+-CaM جدا شده و در لایه لیپیدی فرو می‌رود که منجر به تضعیف پیوند و آزادسازی CaM می‌شود.

روش پژوهش

eFRET برای تعیین قدرت پیوند و مناطق فرعی Vpu درگیر در پیوند با CaM استفاده شد. تمامی واریانت‌های Vpu با Cy3 و Ca2+-CaM با Cy5 برچسب‌گذاری شدند.

محدودیت‌ها

محدودیت‌های گزارش نشده در متن موجود است.

استخراج ساختاریافته از متن منبع

نمای PICO و پیامدها

جمعیت
هیچ جمعیت انسانی گزارش نشده است.
مداخله/مواجهه
HIV-1 Vpu و کال‌مودولین یونیزه شده با کلسیم (Ca2+-CaM)
مقایسه
هیچ مقایسه‌ای گزارش نشده است.
حجم نمونه
میزان نمونه گزارش نشده است.

متن کامل اصلی

نسخه دارای مجوز در منبع علمی در دسترس است.

لینک مستقیم از metadata منبع گرفته شده و در تب جدید باز می‌شود.

باز کردن متن کامل

کلیدواژه‌ها

HIV‐1 Vpu‐calmodulin complexHIV‐1‐host interactionsdissociation constant of protein–protein complexesensemble FRET in protein–protein interactionsprotein–protein binding energies
در همین زیرشاخه

مقاله‌های مرتبط

PubMed2027

Genome Assembly and Annotation of a Plant Pathogen Using the Example of Botrytis cinerea.

The availability of a high-quality genome assembly facilitates the analysis of fungal genomes. This chapter outlines the tools and steps involved in genome sequence assembly and annotation of a plant pathogen, Botrytis cinerea. We describe the use of Illumina short-read and Oxford Nanopore long-read sequencing data to assemble the B. cinerea genome. The steps include the pre-processing of sequencing data, genome assembly using Flye, sc…

PubMed2027

Topic-Driven Bibliometrics and Trend Intelligence for Stem Cell and Cancer Research.

The rapid growth of biomedical literature has created an urgent need for computational tools that enable researchers to systematically analyze publication trends, identify emerging research themes, and map the evolution of scientific fields. PubMed Atlas is a command-line and web-enabled workflow for topic-driven bibliometrics and trend intelligence using PubMed E-utilities. The pipeline executes PubMed queries, retrieves matching PMID…

PubMed2026

Caring Behaviours in Nursing: A Bibliometric Analysis of Global Research Trends and Knowledge Structure.

BACKGROUND: Caring behaviours constitute one of the most visible ways in which "caring" is translated into everyday nursing practice, yet the field has become increasingly heterogeneous across settings, outcomes, and conceptual traditions. A field-level map is therefore needed to clarify how the literature has evolved and where it is currently concentrating. OBJECTIVE: This study aimed to bibliometrically map the literature on caring b…

PubMed2026

Culturally Embedded Participation Restrictions in Indian Adults With Knee Osteoarthritis: An ICF-Based Qualitative Study.

OBJECTIVE: To identify culturally relevant functioning issues experienced by Indian adults with knee osteoarthritis (KOA) using the International Classification of Functioning, Disability and Health (ICF) framework. METHODS: A qualitative descriptive study using semi-structured focus group interviews was conducted with 38 ambulatory adults (35-85 years) diagnosed with knee osteoarthritis (KOA). Participants were recruited from physioth…