Unraveling the epidemiological and dispersal dynamics of the 2024-2025 chikungunya virus epidemic on Réunion Island.

چکیده اصلی

Réunion Island experienced a massive chikungunya virus epidemic in 2024-2025, with >54,000 confirmed cases. This is the second major chikungunya epidemic on the island, following the first one that peaked 20 years ago. It has been asserted that this new outbreak finds its origin in a single introduction event into the island, offering an opportunity to exploit viral genomic data to understand the epidemiological and dispersal dynamics of the introduced transmission chain. We sequenced >3,000 viral genomes collected during the epidemic. Harnessing this genomic dataset, we used several phylogeographic and phylodynamic approaches to unravel the paths taken by the transmission chain and the external factors that might have impacted its dispersal and epidemiological dynamics on the island. Our analyses highlight a dispersal pattern in line with a gravity-model dynamic with viral transition events being more frequent from and toward more populated areas. Our analyses reveal that the transmission chain was overall spatially intermixed, with frequent exchanges among residential areas. In addition, we show that the temporal dynamic and intensity of the epidemic were associated with climatic variables, namely temperature and precipitation. Our results also show that in theory, the population immunity-resulting from this epidemic and the previous one (2005-2006)-could be sufficient to explain on its own the decrease in the transmission rate that led to the end of the epidemic. While a short-term resurgence cannot be excluded, the risk of a large-scale circulation of the virus in the human population appears therefore relatively limited in the upcoming seasons.

ترجمه فارسی چکیده

جزیره رئونیون در سال‌های ۲۰۲۴-۲۰۲۵ با بیش از ۵۴۰۰۰ مورد تأییدشده با ویروس چیکونگونیا روبرو شد. این دومین اپیدمی بزرگ در جزیره پس از اپیدمی اولیه که ۲۰ سال پیش اوج گرفت، است. این گسترش جدید ریشه در یک رویداد ورودی واحد به جزیره دارد. ما بیش از ۳۰۰۰ ژنوم ویروسی را در طول اپیدمی توالی‌یابی کردیم. تحلیل‌های ما الگوی پخش را با پویایی مدل جاذبه نشان می‌دهند و رویدادهای انتقال ویروسی در مناطق پرجمعیت‌تر بیشتر است. تحلیل‌ها نشان می‌دهد که زنجیره انتقال در مقیاس فضایی آمیخته است و تعاملات بین مناطق مسکونی فراوان است. همچنین، دینامیک زمانی و شدت اپیدمی با متغیرهای اقلیمی، به ویژه دما و بارش مرتبط است. نتایج نشان می‌دهد که ایمنی جمعی ناشی از این اپیدمی و اپیدمی قبلی (۲۰۰۵-۲۰۰۶) می‌تواند به تنهایی کاهش نرخ انتقال را توضیح دهد. با این حال، خطر پخش گسترده ویروس در انسان در فصول آینده محدود به نظر می‌رسد.

متن کامل اصلی