PubMed چکیده/رکورد

Genomic Profiling of Chromatin State Using CUT&Tag.

Fanju W Meng, Duy K Nguyen, Patrick J Murphy• 2027• Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
استودیوی صوتی مقاله

پخش حرفه‌ای فارسی و انگلیسی

در حال بررسی نسخه‌های صوتی ذخیره‌شده…

صوت تولیدشده با هوش مصنوعی است. برای کاربرد علمی یا درمانی، متن و منبع اصلی را بررسی کنید.
خواندن هوشمند فارسی و انگلیسی در حال آماده‌سازی صداهای مرورگر…
تنظیم صدای طبیعی و سرعت

صداهایی که در نامشان «Natural»، «Neural» یا «Online» دیده می‌شود معمولاً طبیعی‌ترند. انتخاب صدا به صداهای نصب‌شده در ویندوز و مرورگر شما بستگی دارد.

چکیده اصلی

Alterations in chromatin state, mediated through histone modifications and the incorporation of histone variants, are fundamental to establishing transcriptional networks and cell identity. Recent advances in low-input epigenome profiling methods, such as CUT&Tag and CUT&RUN, have enabled the study of chromatin states from very limited starting materials. In this chapter, we describe procedures for generating CUT&Tag libraries to profile histone modifications and histone variants in early-developing zebrafish embryos.

نتیجه فارسی

CUT&Tag روشی برای پروفایل‌سازی وضعیت کروماتین با استفاده از ورودی کم است. این روش برای مطالعه اصلاحات هیستون و واریانت‌های هیستون در جنین‌های زبرفیش در حال توسعه اولیه استفاده می‌شود.

  • CUT&Tag برای مطالعه وضعیت کروماتین با مواد اولیه محدود مناسب است.
  • اصلاحات هیستون و واریانت‌های هیستون بر هویت سلولی تأثیر می‌گذارند.
  • این فصل روال‌های تولید کتابخانه CUT&Tag را توصیف می‌کند.
  • مطالعه در جنین‌های زبرفیش در حال توسعه اولیه انجام شده است.

ترجمه فارسی چکیده

تغییرات وضعیت کروماتین، که از طریق اصلاحات هیستون و ادغام واریانت‌های هیستون mediated می‌شود، بنیادی برای ایجاد شبکه‌های ترجمه‌ای و هویت سلولی است. پیشرفت‌های اخیر در روش‌های پروفایل‌سازی اپی‌ژنوم با ورودی کم، مانند CUT&Tag و CUT&RUN، امکان مطالعه وضعیت کروماتین از مواد اولیه بسیار محدود را فراهم کرده است. در این فصل، ما روال‌های تولید کتابخانه‌های CUT&Tag را برای پروفایل‌سازی اصلاحات هیستون و واریانت‌های هیستون در جنین‌های زبرفیش در حال توسعه اولیه توصیف می‌کنیم.

روش پژوهش

این فصل روال‌های تولید کتابخانه‌های CUT&Tag را برای پروفایل‌سازی اصلاحات هیستون و واریانت‌های هیستون توصیف می‌کند.

محدودیت‌ها

محدودیت‌های روش در متن گزارش نشده است.

استخراج ساختاریافته از متن منبع

نمای PICO و پیامدها

جمعیت
جنین‌های زبرفیش در حال توسعه اولیه
مداخله/مواجهه
CUT&Tag
مقایسه
مورد مقایسه گزارش نشده است
حجم نمونه
گزارش نشده است

متن کامل اصلی

متن در JumpToDate ذخیره نشده است.

برای بررسی دسترسی کتابخانه‌ای یا خرید، رکورد اصلی را باز کنید.

رفتن به منبع اصلی

کلیدواژه‌ها

CUT&TagChromatinEmbryogenesisEpigeneticsEpigenomeHistone modificationsHistone variantsZebrafish
در همین زیرشاخه

مقاله‌های مرتبط

PubMed2027

A Modelling Approach to Resolve Gene Temporal Dynamics in Intestinal Inflammation.

The intestinal epithelium is maintained by stem cells at the crypt base, however, acute or chronic inflammation can severely disrupt stem cell function and tissue homeostasis. To characterize mucosal inflammation and tissue damage, we evaluated time-course gene expression changes using a dextran sulfate sodium (DSS)-induced mouse model of colitis. By applying normalization, Z-score transformation, and spline curve modeling, we trace th…

PubMed2027

A Standardized Protocol for Generating iPSC-Derived Human Microglia for Functional Genomic Assays.

Human induced pluripotent stem cell (iPSC)-derived microglia (iMG) provide an in vitro experimental system for studying human microglial biology, neuroinflammation, and genetic risk mechanisms associated with neurological disease. This chapter describes a standardized, scalable, and reproducible protocol for the differentiation of human iPSCs into functional microglia-like cells, with particular emphasis on applications in transcriptio…

PubMed2027

B-Cell Aware Analysis of Single-Cell Transcriptomics Data.

Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) has facilitated the studies of cellular heterogeneity in many different biological contexts, including how B cells function and mediate immune responses to infection, malignancies, and autoimmunity. scRNA-seq as applied to B cells requires specific bioinformatics strategies, which consider the distinct biology of B cells and biological processes unique to these cells, such as somatic hypermutation…

PubMed2027

Combined Lipidomic and Metabolomic Analyses on Cardiac Organoids.

Cardiac organoids are increasingly used to model human cardiac development and disease, but their small size often limits molecular characterization, especially if different approaches and protocols are necessary to extract and quantify metabolites and lipids. Here, we present a multistep workflow for combined targeted free amino-acid (FAA) based metabolomic and lipidomic profiling from a single pooled cardiac organoid sample. The prot…