Molecular Diagnostics for WHO Priority Bacterial Pathogens: A Bibliometric Mapping of Diagnostic Platforms, Resistance Markers, and Antimicrobial Resistance Research Trends.

چکیده اصلی

Antimicrobial resistance (AMR) constrains effective treatment and carries implications for infection control, surveillance, and public health. The World Health Organization (WHO) priority bacterial pathogen framework has intensified the need for diagnostic innovation by redefining research priorities around organisms combining high disease burden with complex resistance profiles. Molecular diagnostics have accordingly moved beyond culture-based workflows, integrating rapid pathogen identification, resistance-marker detection, genomic surveillance, and clinical decision support. The present study conducted a bibliometric mapping of the literature on WHO priority pathogens. Rather than addressing resistance at a general level or a single pathogen or technology, it integrates priority pathogens, molecular platforms, and resistance markers within a single framework, tracing their joint thematic and temporal evolution along an explicit pathogen-platform-marker axis. Scopus-indexed articles and reviews (2000-2025) were retrieved, yielding 1746 publications after screening adapted from the Preferred Reporting Items for Systematic Reviews and Meta-Analyses (PRISMA) guidelines. Analyses used Bibliometrix/Biblioshiny, R, and VOSviewer. The literature expanded markedly after 2018, led by China and the United States. Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA), Mycobacterium tuberculosis, Enterococcus faecium, and the Enterobacterales-carbapenemase axis constituted the principal thematic cores, whereas conventional polymerase chain reaction (PCR)/nucleic acid amplification testing (NAAT) and whole-genome sequencing were the dominant platforms. Overall, the field has evolved from pathogen detection into an AMR-centered translational domain encompassing resistance prediction, genomic epidemiology, surveillance, and clinical decision support. Diagnostic development, stewardship, and surveillance depend on hybrid workflows coupling rapid marker-targeted assays with genome-based characterization, delivering actionable resistance within clinically meaningful timeframes, and extending coverage to underrepresented pathogens and platforms.

ترجمه فارسی چکیده

مقاومت آنتی‌بیوتیکی (AMR) محدودیت‌هایی برای درمان مؤثر ایجاد می‌کند و پیامدهایی برای کنترل عفونت، نظارت و سلامت عمومی دارد. چارچوب عوامل باکتریایی اولویت‌دار سازمان جهانی بهداشت (WHO) نیاز به نوآوری در تشخیص را با بازتعریف اولویت‌های تحقیق در مورد ارگانیسم‌هایی که بار بیماری بالایی دارند و پروفایل‌های پیچیده مقاومت دارند، تشدید کرده است. بنابراین، تشخیص‌های مولکولی فراتر از کاربردهای مبتنی بر کشت حرکت کرده‌اند و شناسایی سریع عامل بیماری، تشخیص نشانگرهای مقاومت، نظارت ژنومیک و پشتیبانی از تصمیمات بالینی را ادغام کرده‌اند. این مطالعه نقشه‌برداری کتاب‌شناختی از ادبیات در مورد عوامل باکتریایی اولویت‌دار WHO را انجام داد. به جای بررسی مقاومت به صورت کلی یا یک عامل یا تکنولوژی خاص، این مطالعه عوامل اولویت‌دار، پلتفرم‌های مولکولی و نشانگرهای مقاومت را در یک چارچوب واحد ادغام کرده و تکامل موضوعی و زمانی مشترک آن‌ها را در یک محور مشخص عامل-پلتفرم-نشانگر ردیابی کرده است. مقالات و مرورهای ادبیات شاخص شده در Scopus (2000-2025) پس از غربالگری بر اساس دستورالعمل‌های PRISMA، ۱۷۴۶ انتشار را به دست آوردند. تحلیل‌ها با استفاده از Bibliometrix/Biblioshiny، R و VOSviewer انجام شد. ادبیات پس از سال ۲۰۱۸ به طور چشمگیری گسترش یافت و توسط چین و ایالات متحده رهبری می‌شد. استافیلوکوک aureus مقاوم به متیکیلین (MRSA)، میکوباکتریوم توبرکولوز، انتروکوکوس فئکیم و محور انتروباکتریال‌های کرباپنمز، هسته‌های موضوعی اصلی را تشکیل دادند، در حالی که پلیمراز زنجیره‌ای (PCR) متداول/تست تکرار اسید نوکلئیک (NAAT) و توالی‌یابی ژنوم کامل پلتفرم‌های غالب بودند. به طور کلی، این حوزه از تشخیص عامل بیماری به یک حوزه ترجمه‌ای متمرکز بر AMR که شامل پیش‌بینی مقاومت، اپیدمیولوژی ژنومیک، نظارت و پشتیبانی از تصمیمات بالینی است، تکامل یافته است. توسعه تشخیصی، مدیریت و نظارت به کاربردهای هیبریدی وابسته است که آزمون‌های سریع مبتنی بر نشانگر را با توصیف مبتنی بر ژنوم جفت می‌کند تا مقاومت قابل اقدام را در بازه‌های زمانی بالینی معنی‌دار ارائه دهد و پوشش را به عوامل و پلتفرم‌های کمتر نمایندگی شده گسترش دهد.

متن کامل اصلی