Development and Evaluation of a Colourimetric LAMP Assay for Field Detection of Erysipelothrix rhusiopathiae in Poultry Using a Rapid DNA Extraction Method.

چکیده اصلی

BACKGROUND: Rapid and reliable diagnostic methods suitable for field use are needed for the detection of Erysipelothrix rhusiopathiae in poultry. OBJECTIVES: This study aims to develop and evaluate a colourimetric loop-mediated isothermal amplification (LAMP) assay for the rapid detection of E. rhusiopathiae in conjunction with a rapid DNA extraction procedure suitable for field conditions. METHODS: Specific primers targeting a conserved region of a putative polypeptide gene involved in the synthesis of capsular polysaccharides were used for LAMP and PCR. The specificity of the developed assays was evaluated using 13 unrelated bacterial strains. The efficacy of the assays was assessed using positive controls and 52 clinical samples collected from poultry farms experiencing erysipelas. RESULTS: Both LAMP and PCR showed high sensitivity and specificity when compared with bacterial culture. LAMP and PCR achieved 100% sensitivity and specificity when combined with the rapid DNA extraction method. Using a commercial DNA extraction kit, LAMP maintained 100% sensitivity and specificity, whereas PCR showed 100% sensitivity and 97.8% specificity. The high correlation observed between bacterial culture and the LAMP assay demonstrated the effectiveness and reliability of the rapid DNA extraction method. CONCLUSIONS: The developed colourimetric LAMP assay provides a rapid, sensitive, and practical diagnostic tool for the detection of E. rhusiopathiae in poultry. The assay requires minimal instrumentation, enables straightforward visual interpretation of results, and is suitable for point-of-care testing and resource-limited settings.

ترجمه فارسی چکیده

هدف این مطالعه توسعه و ارزیابی یک تست رنگی LAMP برای تشخیص سریع Erysipelothrix rhusiopathiae در طیور همراه با روشی سریع استخراج DNA مناسب برای شرایط میدانی است. تست‌های LAMP و PCR با استفاده از 13 گونه باکتری غیرمرتبط ارزیابی شدند. حساسیت و ویژگی‌شناسی تست‌ها با نمونه‌های بالینی 52 موردی که از مزارع طیور با بیماری اریسیپلاس جمع‌آوری شده بودند، بررسی شد. نتایج نشان داد که LAMP و PCR همبستگی بالایی با کشت باکتری داشتند. با استفاده از روش استخراج DNA سریع، هر دو تست 100٪ حساسیت و ویژگی‌شناسی داشتند. با استفاده از یک کیت تجاری، LAMP 100٪ حساسیت و ویژگی‌شناسی داشت، در حالی که PCR 100٪ حساسیت و 97.8٪ ویژگی‌شناسی را نشان داد. نتیجه‌گیری: تست رنگی LAMP توسعه‌یافته، ابزاری تشخیصی سریع، حساس و عملی برای تشخیص Erysipelothrix rhusiopathiae در طیور است.

متن کامل اصلی