Molecular Epidemiology of Peste des Petits Ruminants Virus Circulating in Fat-Tailed Sheep in Bangladesh.

چکیده اصلی

BACKGROUND: Peste des petits ruminants (PPR) is a highly contagious viral disease of sheep and goats that causes substantial economic losses through high morbidity, mortality and rapid transmission among small ruminants. Molecular epidemiological data on circulating PPR virus (PPRV) strains in Bangladesh remain limited. OBJECTIVES: To investigate the molecular epidemiology and phylogenetic characteristics of PPRV among fat-tailed sheep and goats traded in livestock markets in Bangladesh. METHODS: A cross-sectional survey was conducted in livestock markets in Dhaka city, Bangladesh, during the Eid-ul-Adha festival between August and October from 2015 to 2018. Oral, nasal and rectal swabs were collected from 161 animals comprising 141 sheep (including 111 fat-tailed sheep) and 20 goats. Samples were screened for PPRV using conventional hemi-nested polymerase chain reaction (PCR) targeting the nucleocapsid gene. Positive amplicons were sequenced, analysed phylogenetically and subjected to three-dimensional (3D) structural prediction of the RNA-dependent RNA polymerase protein. RESULTS: The overall prevalence of PPRV in small ruminants was 2.5% (95% confidence interval [CI]: 0.7-6.2). In fat-tailed sheep, the prevalence was 3.6% (95% CI: 1.0-8.9), whereas no positive cases were detected among goats. A significantly higher (p < 0.05) prevalence was observed in animals sampled from the Gabtoli livestock market. Phylogenetic analysis revealed that two of the four positive samples clustered closely with PPRV strains from India and the United Arab Emirates, whereas the other two clustered with strains from China and Tibet. CONCLUSIONS: These findings demonstrate the transboundary circulation of genetically diverse PPRV strains among small ruminants traded in livestock markets in Bangladesh. Strengthened molecular surveillance in livestock markets and coordinated regional control strategies are needed to support PPR prevention and eradication.

ترجمه فارسی چکیده

پست دس پتیت رامینتس (PPR) یک بیماری ویروسی بسیار عفونی گوسفند و بز است که باعث ضررهای اقتصادی قابل توجهی از طریق میزان بالای بیماری‌زایی، مرگ‌ومیر و انتقال سریع بین دام‌های کوچک می‌شود. داده‌های مولکولی اپیدمیولوژیک در مورد استرین‌های در حال گردش ویروس PPR در بنگلادش محدود باقی مانده است. هدف این مطالعه بررسی مولکولی اپیدمیولوژی و ویژگی‌های فیلوژنتیک PPRV در گوسفندان و بزهای دم‌دراز معامله‌شده در بازارهای دام در بنگلادش بود. یک مطالعه مقطعی در بازارهای دام شهر داکا، بنگلادش در جریان جشن Eid-ul-Adha بین اوت و اکتبر از ۲۰۱۵ تا ۲۰۱۸ انجام شد. نمونه‌های دهان، بینی و مقعد از ۱۶۱ حیوان شامل ۱۴۱ گوسفند (شامل ۱۱۱ گوسفند دم‌دراز) و ۲۰ بز جمع‌آوری شد. نمونه‌ها برای PPRV با استفاده از PCR نیمه‌تکرار کلاسیک هدف‌گذاری شده بر روی ژن کپسید اسید نوکلئیک اسکن شدند. آمپلیکون‌های مثبت توالی‌یابی شدند، فیلوژنتیکاً تحلیل شدند و به پیش‌بینی ساختاری سه‌بعدی پروتئین پلیمراز RNA وابسته به RNA زیر نظر گرفته شدند. میزان شیوع کلی PPRV در دام‌های کوچک ۲.۵٪ (۹۵٪ CI: ۰.۷-۶.۲) بود. در گوسفندان دم‌دراز، شیوع ۳.۶٪ (۹۵٪ CI: ۱.۰-۸.۹) بود، در حالی که هیچ مورد مثبت در بزها تشخیص داده نشد. شیوع بالاتر معناداری (p < 0.05) در حیوانات نمونه‌برداری شده از بازار دام Gabtoli مشاهده شد. تحلیل فیلوژنتیک نشان داد که دو از چهار نمونه مثبت به طور نزدیک به استرین‌های PPRV از هند و امارات متحده عربی دسته‌بندی شدند، در حالی که دو مورد دیگر با استرین‌های چین و تبت دسته‌بندی شدند. این یافته‌ها نشان‌دهنده گردش مرزی استرین‌های ژنتیکی متنوع PPRV در میان دام‌های کوچک معامله‌شده در بازارهای دام بنگلادش هستند. نظارت مولکولی قوی‌تر در بازارهای دام و استراتژی‌های کنترل منطقه‌ای هماهنگ برای حمایت از پیشگیری و eradication PPR مورد نیاز است.

متن کامل اصلی