An Exploratory Immune-Associated Prognostic Signature and AREG-Associated Phenotypes in Oral Squamous Cell Carcinoma.

چکیده اصلی

BACKGROUND: Oral squamous cell carcinoma (OSCC) remains a clinically heterogeneous malignancy with unsatisfactory long-term outcomes, particularly in patients with advanced disease and treatment resistance. Conventional clinicopathologic parameters incompletely capture the biological diversity of OSCC and provide limited guidance for individualised therapeutic stratification. METHODS: We performed an integrated transcriptomic analysis of TCGA-derived OSCC data to construct and evaluate an immune-associated prognostic signature. Associations with survival, clinicopathologic features, immune infiltration, somatic mutation profiles and pathway-level biological programs were assessed. The manuscript-specified ten-gene equation was additionally evaluated without refitting in an independent CPTAC oral-cavity SCC cohort using overall survival, Harrell's C-index and time-dependent ROC analysis. Amphiregulin (AREG) was selected for functional investigation using siRNA-mediated knockdown, proliferation assays, cisplatin sensitivity testing, IC50 estimation and apoptosis analysis in OSCC cells. RESULTS: The original TCGA analysis separated survival groups and reported 1-, 3- and 5-year AUCs of 0.701, 0.693 and 0.623. In 42 independent CPTAC patients with 14 deaths, however, the fixed score was not significantly associated with overall survival (HR per SD, 1.181; 95% CI, 0.674-2.069; p = 0.561). The C-index was 0.521, and the 1- and 3-year AUCs were 0.369 and 0.550; 5-year evaluation was unsupported by follow-up. The supplied AREG experiments suggested reduced proliferation and increased cisplatin sensitivity after knockdown. CONCLUSIONS: This study identifies an exploratory immune-associated score and AREG-associated cellular phenotypes in OSCC.

ترجمه فارسی چکیده

کارسینومای اسکواموس دهانی (OSCC) یک بدخیمی بالینی متنوع با نتایج بلندمدت ناکافی باقی مانده است، به‌ویژه در بیماران مبتلا به بیماری پیشرفته و مقاوم به درمان. پارامترهای بالینی-پاتولوژیک معمولی تنوع زیستی OSCC را به‌طور کامل ثبت نمی‌کنند و راهنمایی محدودی برای طبقه‌بندی درمان فردی ارائه می‌دهند. این مطالعه یک تحلیل ترنسکریپتومیک یکپارچه از داده‌های OSCC حاصل از TCGA برای ساخت و ارزیابی یک امضای پیش‌بینی‌کننده مرتبط با ایمنی انجام داد. ارتباط با بقا، ویژگی‌های بالینی-پاتولوژیک، نفوذ ایمنی، پروفایل‌های جهش سوماتیک و برنامه‌های زیستی سطح مسیر ارزیابی شد. معادله ۱۰ ژنی مشخص در دستور کار به‌طور مستقل در یک کوهورت CPTAC دهان-حلقوی SCC ارزیابی شد. همچنین، آمفی‌رگولین (AREG) برای بررسی عملکردی با استفاده از کاهش mediated با siRNA، آزمون‌های تکثیر، تست حساسیت به سیس‌پلاتین، برآورد IC50 و تحلیل آپوپتوز در سلول‌های OSCC انتخاب شد. تحلیل TCGA اصلی گروه‌های بقا را تفکیک کرد و AUCهای ۱، ۳ و ۵ ساله را ۰.۷۰۱، ۰.۶۹۳ و ۰.۶۲۳ گزارش داد. با این حال، در ۴۲ بیمار مستقل CPTAC، امتیاز ثابت به طور معناداری با بقا کلی مرتبط نبود. C-index ۰.۵۲۱ بود و AUCهای ۱ و ۳ ساله ۰.۳۶۹ و ۰.۵۵۰ بودند. ارزیابی ۵ ساله توسط پیگیری پشتیبانی نمی‌شد. آزمایش‌های AREG ارائه شده نشان‌دهنده کاهش تکثیر و افزایش حساسیت به سیس‌پلاتین پس از کاهش بود.

متن کامل اصلی