PubMed چکیده/رکورد

A Lightweight Framework for Medical Named Entity Recognition and Relation Extraction.

استودیوی صوتی مقاله

پخش حرفه‌ای فارسی و انگلیسی

در حال بررسی نسخه‌های صوتی ذخیره‌شده…

صوت تولیدشده با هوش مصنوعی است. برای کاربرد علمی یا درمانی، متن و منبع اصلی را بررسی کنید.
خواندن هوشمند فارسی و انگلیسی در حال آماده‌سازی صداهای مرورگر…
تنظیم صدای طبیعی و سرعت

صداهایی که در نامشان «Natural»، «Neural» یا «Online» دیده می‌شود معمولاً طبیعی‌ترند. انتخاب صدا به صداهای نصب‌شده در ویندوز و مرورگر شما بستگی دارد.

چکیده اصلی

INTRODUCTION: Clinical text in electronic health records contains valuable information for medical research. Named entity recognition (NER) and relation extraction (RE) are key tasks for structuring this information, but existing deep learning approaches are often computationally expensive. METHODS: We develop a lightweight, pipeline-based NER-RE system using neural networks with contextualized embeddings based on spaCy and Thinc. The impact of data preprocessing and hyperparameter tuning (HPT) on NER is evaluated. RE is performed using a separate classifier on candidate entity pairs. Experiments are conducted on i2b2 and n2c2 datasets. RESULTS: The approach achieves strong NER performance after optimization. Better data quality or applying HPT improve performance comparably, but combining both yields only marginal gains additionally. DISCUSSION: Lightweight models are effective for NER but limited for RE due to error propagation. Our NER results also suggest that HPT can compensate for data quality issues.

نتیجه فارسی

این مطالعه یک سیستم سبک برای شناسایی موجودیت‌های نام‌دار و استخراج روابط در متن‌های بالینی توسعه می‌دهد. رویکرد بر پایه شبکه‌های عصبی و توصیف‌های زمینه‌ای است و بر روی مجموعه داده‌های i2b2 و n2c2 آزمایش شده است. بهینه‌سازی پارامترها و کیفیت داده‌ها هر دو به طور قابل مقایسه عملکرد را بهبود می‌دهند، اما ترکیب آن‌ها سود حاشیه‌ای ایجاد می‌کند. مدل‌های سبک برای شناسایی موجودیت مؤثرند اما برای استخراج روابط محدود هستند.

  • توسعه یک سیستم سبک NER-RE مبتنی بر شبکه‌های عصبی
  • ارزیابی اثر پیش‌پردازش داده‌ها و تنظیم پارامترها
  • نتایج قوی برای NER پس از بهینه‌سازی
  • محدودیت مدل‌های سبک در استخراج روابط به دلیل انتشار خطا
  • جبران مشکلات کیفیت داده‌ها با تنظیم پارامترها

ترجمه فارسی چکیده

متن‌های بالینی در سوابق الکترونیک سلامت اطلاعات ارزشمندی برای تحقیقات پزشکی دارند. شناسایی موجودیت‌های نام‌دار (NER) و استخراج روابط (RE) وظایف کلیدی برای ساختاردهی این اطلاعات هستند، اما رویکردهای یادگیری عمیق موجود اغلب پرهزینه محاسباتی هستند. ما یک سیستم سبک و مبتنی بر خط لوله NER-RE با استفاده از شبکه‌های عصبی و توصیف‌های زمینه‌ای مبتنی بر spaCy و Thinc توسعه دادیم. اثر پیش‌پردازش داده‌ها و تنظیم پارامترهای فراپارامتریک (HPT) بر NER ارزیابی شد. RE با استفاده از یک طبقه‌بندهای جداگانه روی جفت‌های موجودیت‌های کاندیدا انجام شد. آزمایش‌ها در مجموعه داده‌های i2b2 و n2c2 انجام شد. رویکرد پس از بهینه‌سازی عملکرد NER قویی را به دست آورد. بهبود کیفیت داده‌ها یا اعمال HPT عملکرد را به طور قابل مقایسه بهبود می‌دهند، اما ترکیب هر دو تنها سود حاشیه‌ای اضافی ایجاد می‌کند. مدل‌های سبک برای NER مؤثر هستند اما به دلیل انتشار خطا برای RE محدود هستند. نتایج NER ما همچنین نشان می‌دهد که HPT می‌تواند مشکلات کیفیت داده‌ها را جبران کند.

روش پژوهش

سیستم سبک و مبتنی بر خط لوله NER-RE با استفاده از شبکه‌های عصبی و توصیف‌های زمینه‌ای مبتنی بر spaCy و Thinc توسعه یافت. اثر پیش‌پردازش داده‌ها و تنظیم پارامترهای فراپارامتریک (HPT) بر NER ارزیابی شد. RE با استفاده از یک طبقه‌بندهای جداگانه روی جفت‌های موجودیت‌های کاندیدا انجام شد. آزمایش‌ها در مجموعه داده‌های i2b2 و n2c2 انجام شد.

محدودیت‌ها

مدل‌های سبک برای استخراج روابط محدود هستند به دلیل انتشار خطا. ترکیب بهبود کیفیت داده‌ها و تنظیم پارامترها تنها سود حاشیه‌ای ایجاد می‌کند.

استخراج ساختاریافته از متن منبع

نمای PICO و پیامدها

جمعیت
متن‌های بالینی در سوابق الکترونیک سلامت
مداخله/مواجهه
سیستم سبک NER-RE مبتنی بر شبکه‌های عصبی و توصیف‌های زمینه‌ای
مقایسه
رویکردهای یادگیری عمیق موجود
حجم نمونه
نامشخص

متن کامل اصلی

متن در JumpToDate ذخیره نشده است.

برای بررسی دسترسی کتابخانه‌ای یا خرید، رکورد اصلی را باز کنید.

رفتن به منبع اصلی

کلیدواژه‌ها

Medical InformaticsNERREimproved data processing and hyperparameter tuninglightweight system
در همین زیرشاخه

مقاله‌های مرتبط

PubMed2026

Clinical effectiveness and safety of metadoxine in the management of acute alcohol intoxication: A single-center retrospective cohort study.

BACKGROUND: Acute alcohol intoxication (AAI) is a common emergency with no specific antidote. Metadoxine has shown potential but lacks sufficient real-world evidence, particularly in Chinese populations. OBJECTIVES: To evaluate the clinical efficacy and safety of metadoxine in patients with acute alcohol intoxication. METHODS: This single-center retrospective cohort study included 124 patients with AAI admitted to an emergency departme…

PubMed2026

D3MI: an efficient and powerful federated imputation method for bias reduction in the analysis of distributed incomplete data by accounting for within-site correlation and between-site heterogeneity.

BACKGROUND: Electronic health records (EHRs) collected from diverse healthcare institutions offer a rich and representative data source for clinical research. Federated learning enables analysis of these distributed data without sharing sensitive patient-level information, preserving privacy. However, missing data remain a major challenge and can introduce substantial bias if not properly addressed. Very few distributed imputation meth…

PubMed2026

Extraction of Pain Severity and Functional Interference From Clinical Narratives Using Domain-Informed Large Language Models: Protocol for a Development and Validation Study.

BACKGROUND: Chronic pain is a leading cause of disability and requires multidimensional assessment of pain intensity and functioning, yet electronic health records rarely capture these measures systematically. By contrast, surveys collecting patient-reported outcomes can assess pain over multiple dimensions but remain resource-intensive and difficult to scale for continuous population-level monitoring. OBJECTIVE: The objective of this …

PubMed2026

From data entry to digital transformation: Allied health perspectives on standardised electronic medical records data.

BACKGROUND: Electronic medical records (EMRs) currently rely on standardised data fields to support secondary data use for clinical care, performance monitoring, and system-level reporting. However, utilisation of standardised data capture and reporting within allied health remains underdeveloped in practice. Greater understanding of how allied health clinicians and managers perceive the purpose, value, and impact of standardised data …