PSMA1, PSMA5, and PSMB2 serve as prognostic biomarkers and are correlated with tumor-infiltrating leukocytes in HCC.

چکیده اصلی

Hepatocellular carcinoma (HCC) ranks as the third leading cause of cancer-related death. Proteasome (PSM) is the main intracellular proteolytic system in higher eukaryotic cells. It has been reported to be involved in the tumor's onset, metabolism, and survival, and it has been recognized as a therapeutic target for many human cancers. The 20S proteasome subunits, specifically proteasome 20S subunit alpha 1 (PSMA1), proteasome 20S subunit alpha 5 (PSMA5), and proteasome 20S subunit beta 2 (PSMB2), are overexpressed in various malignancies, including HCC. Nevertheless, the exact role of these genes in HCC prognosis remains only partially understood. Moreover, a reliable predictive biomarker for HCC is essential for supporting the implementation of personalized therapies. Therefore, this study employed a comprehensive bioinformatics approach, integrating data from cBioPortal, Human Protein Atlas (HPA), Oncomine, STRING Viruses, Kaplan-Meier plotter, and other established high-throughput databases and tools. The current study thoroughly examined the expression levels, methylation, and genomic alterations of PSM and their correlation with tumor-infiltrating leukocytes. PSMA1, PSMA5, and PSMB2 are overexpressed in various cancers, including HCC, and their expression levels are associated with tumor grade and stage. The abundance of these genes is linked to diminished DNA methylation levels and genome alterations. Moreover, there was a significant association between the expression levels of these genes and poor prognosis and immune cell infiltration. In conclusion, this study proposes PSMA1, PSMA5, and PSMB2 as biomarkers for HCC.

ترجمه فارسی چکیده

سرطان کبد سلولی (HCC) سومین علت اصلی مرگ‌ومیر ناشی از سرطان است. پروتئازوم (PSM) سیستم اصلی پروتئولیتیک داخل سلولی در یوکاریوت‌های بالاتر است. گزارش شده است که در شروع، متابولیسم و بقا تومارها دخیل است و به عنوان هدف درمانی بسیاری از سرطان‌های انسانی شناخته شده است. زیردسته‌های ۲۰S پروتئازوم، به طور خاص پروتئازوم ۲۰S زیردسته آلفا ۱ (PSMA1)، پروتئازوم ۲۰S زیردسته آلفا ۵ (PSMA5) و پروتئازوم ۲۰S زیردسته بتا ۲ (PSMB2)، در سرطان‌های مختلف از جمله HCC بیش‌ازحد بیان می‌شوند. با این حال، نقش دقیق این ژن‌ها در پیش‌بینی HCC هنوز تا حدی درک نشده است. این مطالعه از رویکرد جامع بیوانفورماتیک برای بررسی بیان، متیلاسیون و تغییرات ژنومیک PSM و همبستگی آن‌ها با لنفوسیت‌های نفوذکننده تومور استفاده کرد. بیان PSMA1، PSMA5 و PSMB2 در سرطان‌های مختلف از جمله HCC بالاتر است و سطوح بیان آن‌ها با درجه و مرحله تومار مرتبط است. غلظت این ژن‌ها با سطوح پایین‌تر متیلاسیون DNA و تغییرات ژنومیک مرتبط است. علاوه بر این، همبستگی معناداری بین سطوح بیان این ژن‌ها و پیش‌بینی بد و نفوذ سلول‌های ایمنی وجود داشت. در نتیجه، این مطالعه PSMA1، PSMA5 و PSMB2 را به عنوان نشانگرهای HCC پیشنهاد می‌کند.

متن کامل اصلی